24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3029 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  98.33 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  74.58 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  75 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  71.93 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  51.79 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  48.21 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2850  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  48.21 
 
 		 272 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  49.09 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  47.27 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  47.27 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  47.27 
 
 		 272 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  49.09 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  47.27 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  47.27 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  47.27 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  43.86 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  49.09 
 
 		 291 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  49.09 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  49.09 
 
 		 290 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  47.27 
 
 		 270 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>