29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1556 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.209427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0567  hypothetical protein  64.67 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12006  hypothetical protein  73.68 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525757  normal  0.57612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0523  hypothetical protein  64 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1733  hypothetical protein  63.33 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1705  hypothetical protein  63.33 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1683  hypothetical protein  63.33 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1749  hypothetical protein  63.33 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3825  hypothetical protein  65.73 
 
 		 161 aa  203  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392195  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2711  hypothetical protein  65.15 
 
 		 162 aa  190  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4106  hypothetical protein  60 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0917  hypothetical protein  61.81 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.79 
 
 		 213 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  33.64 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.48 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.28 
 
 		 444 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  33.64 
 
 		 465 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  34.38 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 279 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.52 
 
 		 443 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  29.36 
 
 		 458 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  30.84 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  31.45 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  29.46 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  32.23 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  27.36 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  30.85 
 
 		 255 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  31.13 
 
 		 300 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>