56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0122 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 148 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 148 aa  308  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 		 146 aa  248  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  76.55 
 
 		 146 aa  246  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  65.75 
 
 		 161 aa  208  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  26.06 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  27.61 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  22.54 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  26.81 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  25.49 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  23.02 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  27.14 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  26.62 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  27.01 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  26.47 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  20.29 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  21.43 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  23.94 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  22.12 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  23.08 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  25.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  31.67 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  23.02 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  23.74 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  23.74 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  25.48 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  39.02 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  23.33 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 319 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  23.02 
 
 		 145 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>