46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3001 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  96.9 
 
 
355 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  96.9 
 
 
355 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  62.57 
 
 
395 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  59.95 
 
 
412 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  54.9 
 
 
394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  51.4 
 
 
396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  47.75 
 
 
391 aa  279  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  45.48 
 
 
397 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  43.38 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  47.08 
 
 
391 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  42.29 
 
 
392 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  29.19 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  27.51 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  30.15 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  28.48 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  30.25 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  29.3 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  28.89 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  26.25 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  26.75 
 
 
373 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  26.54 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  28.88 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  28.99 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  26.5 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  26.02 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  26.38 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  26.3 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  27.24 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  30.04 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  29.4 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  28.87 
 
 
355 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  31.54 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  25.86 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  27.21 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  29.53 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  27.27 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  31.44 
 
 
397 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  28.93 
 
 
371 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  26.2 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  23.12 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  27.55 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  25.66 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  25.53 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>