54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0427 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  100 
 
 
410 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  99.27 
 
 
424 aa  783    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  99.27 
 
 
424 aa  783    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  83.7 
 
 
411 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  80.2 
 
 
413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  54.61 
 
 
480 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  51.94 
 
 
563 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  42.48 
 
 
499 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  45.68 
 
 
447 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  41.54 
 
 
436 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  38.59 
 
 
484 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  42.66 
 
 
599 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  47.74 
 
 
448 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  48.06 
 
 
449 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  40.31 
 
 
397 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  40.1 
 
 
428 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  48.62 
 
 
484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  41.42 
 
 
422 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  41.4 
 
 
427 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  38.11 
 
 
513 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  42.86 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  34.61 
 
 
406 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  37.5 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  36.75 
 
 
386 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  45.38 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  37.53 
 
 
404 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  38.77 
 
 
345 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  29.55 
 
 
393 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  39.83 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  27.47 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  29.43 
 
 
392 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  33.86 
 
 
373 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  30.5 
 
 
404 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  26.15 
 
 
393 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  28.57 
 
 
370 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25.97 
 
 
382 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  26.07 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  25.86 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  26.04 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25.7 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  31.51 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  27.8 
 
 
261 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  23.61 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  28.72 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  28.45 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  27.41 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  28.14 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  25.28 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  25.28 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  22.56 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  24.17 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  21.45 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  26.29 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>