59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2964 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  100 
 
 
145 aa  285  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  93.1 
 
 
145 aa  270  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  84.83 
 
 
145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  84.83 
 
 
145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  84.14 
 
 
145 aa  229  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  70.63 
 
 
144 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  51.75 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  50.69 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  53.47 
 
 
145 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  47.92 
 
 
144 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  49.31 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  49.31 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  44.83 
 
 
153 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  46.15 
 
 
146 aa  126  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  47.59 
 
 
152 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  46.9 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  41.78 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 
146 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
156 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
148 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
148 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 
148 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  38.03 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
160 aa  87  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  36.62 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  32.17 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  28.17 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  28.17 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  30.07 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  24.48 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  27.13 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  33.85 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  33.08 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  32.31 
 
 
147 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  25.37 
 
 
150 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  21.74 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  21.74 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_22565  predicted protein  23.74 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0043227  normal  0.0742578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  25.2 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>