40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0338 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  86.81 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  53.33 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  51.72 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  48.89 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  50.57 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  44.32 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  47.73 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  37.65 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  37.65 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  37.08 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  34.09 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0616  hypothetical protein  48.78 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.173694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  36.05 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  34.83 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  35.96 
 
 		 89 aa  48.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  32.58 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  32.58 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  31.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  31.11 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  29.55 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  29.67 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  30.95 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  32.97 
 
 		 95 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  34.09 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  31.18 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  32.97 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  33.7 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  31.18 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  32.95 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 90 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>