23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4188 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  24.04 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  27.84 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  24.58 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  27.06 
 
 
162 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  26.67 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  25.29 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  26.04 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  24.14 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  29.59 
 
 
166 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  26.25 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  26.06 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  28.1 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  26.52 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  22.99 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  22.99 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  26.72 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  22.99 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  25.49 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.49 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.49 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  26.51 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>