23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2883 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  70.37 
 
 
88 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  46.91 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  46.15 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  46.15 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  43.9 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  45.45 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  47.44 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  46.67 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  43.59 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  46.58 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  40.48 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  32.5 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  35.53 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  32 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  32 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2525  hypothetical protein  34.62 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  27.85 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  25.97 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  33.82 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  31.34 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>