38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1791 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  100 
 
 
46 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  65.22 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  71.11 
 
 
48 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  68.89 
 
 
48 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  68.89 
 
 
48 aa  72  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  71.74 
 
 
48 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  71.74 
 
 
52 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  71.74 
 
 
52 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  64.44 
 
 
48 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  60.87 
 
 
48 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  63.04 
 
 
48 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  58.7 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  60 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  58.7 
 
 
48 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  63.04 
 
 
48 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  58.7 
 
 
48 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  58.7 
 
 
49 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  58.54 
 
 
50 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  58.54 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  52.38 
 
 
50 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  52.38 
 
 
50 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  45.65 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2653  hypothetical protein  51.11 
 
 
47 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  51.11 
 
 
47 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  51.11 
 
 
47 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  43.18 
 
 
50 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  61.11 
 
 
48 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1179  hypothetical protein  48.89 
 
 
47 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  57.58 
 
 
43 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  53.85 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  47.5 
 
 
73 aa  42  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1102  protein of unknown function DUF1127  57.14 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0273  hypothetical protein  45.95 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0392259  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  60 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  60 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>