16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1102 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1102  protein of unknown function DUF1127  100 
 
 		 65 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0623  hypothetical protein  55.38 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.16233 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0557  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2209  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.677439  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1229  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3345  hypothetical protein  64.44 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2374  hypothetical protein  47.69 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.34259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4947  hypothetical protein  49.21 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0963  hypothetical protein  48.33 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2848  hypothetical protein  46.81 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  51.16 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  51.16 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  57.14 
 
 		 46 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3878  protein of unknown function DUF1127  37.1 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  54.29 
 
 		 66 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>