18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1747 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  60.66 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  60.66 
 
 
61 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  55.74 
 
 
61 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  37.29 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  44.26 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  34.48 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  32.2 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  48.33 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  35.59 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  33.9 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2016  hypothetical protein  37.7 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1785  hypothetical protein  38.33 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1720  hypothetical protein  38.33 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  41.67 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  31.03 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  27.59 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>