14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0413 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  36.14 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  35.12 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  35.79 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  35.84 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  31.1 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  34.66 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  35.8 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  32.76 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  32.76 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  28.22 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  25.13 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  32.69 
 
 		 104 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  22.67 
 
 		 317 aa  41.6  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>