12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1099 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  52.08 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  42.55 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  52.08 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  48.89 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  44.68 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  42.55 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  46.15 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  48.84 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  39.68 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  42.55 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  39.68 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>