17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1978 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1978    100 
 
 		 192 bp  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1661  transposase and inactivated derivatives-like protein  97.75 
 
 		 246 bp  313  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4235    88.68 
 
 		 962 bp  58  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.816521  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7908    92.5 
 
 		 166 bp  56  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0291    86.44 
 
 		 105 bp  54  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  90.48 
 
 		 477 bp  52  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0803  hypothetical protein  86.79 
 
 		 219 bp  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4598    96.55 
 
 		 571 bp  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1470 bp  48.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8291  transposase and inactivated derivatives-like protein  88.37 
 
 		 192 bp  46.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>