30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0494 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  50.52 
 
 
200 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  51.34 
 
 
230 aa  186  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  48.95 
 
 
191 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  42.16 
 
 
170 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  39.17 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.81 
 
 
210 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.52 
 
 
212 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.61 
 
 
206 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.99 
 
 
212 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.01 
 
 
209 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.49 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.61 
 
 
220 aa  92  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.16 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  29.33 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  41.18 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  31.89 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.56 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  31.94 
 
 
196 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.76 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.77 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.88 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.77 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  35.97 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  36.24 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.15 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.46 
 
 
190 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  30.16 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.94 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>