20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3451 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  66.67 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0355  TM2 domain containing protein?  65.79 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2044  hypothetical protein  35.54 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000114034  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1190  hypothetical protein  35.09 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.550664  normal  0.0144222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22460  hypothetical protein  48.1 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  29.51 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1070  TM2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.607501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0473  hypothetical protein  46.88 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2493  TM2 domain-containing protein  41.33 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1029  hypothetical protein  38.32 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22710  hypothetical protein  43.24 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2096  hypothetical protein  31.86 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  34.09 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  32.18 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  39.66 
 
 		 373 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3060  hypothetical protein  38.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.402263  normal  0.261186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>