47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2960 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2960  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.666408  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  32.43 
 
 
511 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2989  exopolyphosphatase, putative  33.88 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.65 
 
 
513 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0465  exopolyphosphatase-like protein  29.29 
 
 
507 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.655214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  29.08 
 
 
506 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.81 
 
 
513 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  32.19 
 
 
507 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.72 
 
 
920 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.16 
 
 
502 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  28.08 
 
 
513 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  29.66 
 
 
519 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  37.1 
 
 
534 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  27.78 
 
 
521 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  31.3 
 
 
519 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  29.77 
 
 
527 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0336  exopolyphosphatase-like protein  27.56 
 
 
504 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
508 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  30.36 
 
 
534 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  31.12 
 
 
524 aa  55.1  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  26.32 
 
 
501 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1574  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
195 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  33.33 
 
 
514 aa  52  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  32.12 
 
 
500 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  25.61 
 
 
502 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  28.03 
 
 
550 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
544 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  27.91 
 
 
521 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  31.46 
 
 
519 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.43 
 
 
500 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  28 
 
 
505 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0937  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
518 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  32.31 
 
 
553 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  32.86 
 
 
501 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  25.34 
 
 
497 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  36.67 
 
 
519 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  35.48 
 
 
510 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 
545 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 
545 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  31.78 
 
 
549 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
549 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0242  exopolyphosphatase  38.71 
 
 
492 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  30.21 
 
 
520 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  25.99 
 
 
510 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.56 
 
 
502 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.68 
 
 
511 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  30.56 
 
 
502 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>