14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2610 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2610  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  249  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.577355  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  72.55 
 
 		 1238 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1101 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1063 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 496 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 534 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1689 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.92 
 
 		 943 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1958 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  29.29 
 
 		 537 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1526 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1313 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  28.71 
 
 		 689 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1298 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>