35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2501 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  51.69 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  36.79 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  33.92 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1367  RNase P subunit p30  33.91 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  35.23 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  34.03 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  33.79 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  35.33 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  34.5 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  34.78 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  32.58 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  29.27 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  25.58 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  25.85 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  24.55 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  27.23 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0649  phosphotransferase domain-containing protein  28.51 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0472  hypothetical protein  28.38 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0452288  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2310  hypothetical protein  26.46 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1343  hypothetical protein  23.48 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116204  hitchhiker  0.00147591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1589  hypothetical protein  30.52 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.411866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3261  hypothetical protein  25.22 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.260936  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1192  hypothetical protein  26.14 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.13094  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1415  hypothetical protein  22.71 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2006  hypothetical protein  28.11 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.338951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0812  phosphotransferase domain-containing protein  26.91 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1513  hypothetical protein  26.64 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.900194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0333  hypothetical protein  25.43 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.789522 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1134  hypothetical protein  22.17 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1332  hypothetical protein  31.06 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2353  hypothetical protein  29.92 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2482  hypothetical protein  25.49 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  24.27 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  28.24 
 
 		 576 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>