16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1225 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1225  prenyltransferase  100 
 
 		 307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  59.46 
 
 		 307 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  40.34 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2435  prenyltransferase  38.71 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  32.27 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  27.11 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1001  hypothetical protein  32.29 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2064  UbiA prenyltransferase  30.49 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  38.36 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  26.47 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  24.89 
 
 		 577 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  23.47 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  26.42 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.58 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  23.55 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  25.1 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>