16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4265 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  100 
 
 
950 aa  1945    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  34.65 
 
 
783 aa  362  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  34.49 
 
 
783 aa  359  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  31.66 
 
 
792 aa  325  4e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  31.66 
 
 
792 aa  324  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  30.4 
 
 
952 aa  259  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  29.88 
 
 
786 aa  249  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  28.15 
 
 
934 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  27 
 
 
762 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  27 
 
 
762 aa  196  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  24.45 
 
 
763 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0356259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  27.53 
 
 
387 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  22.35 
 
 
590 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  41.46 
 
 
171 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.48 
 
 
589 aa  45.8  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  18.76 
 
 
619 aa  45.8  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>