43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2950 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  296  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  43.24 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  41.82 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  42.74 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  41.96 
 
 
138 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  40.57 
 
 
180 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  41.51 
 
 
183 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  44.23 
 
 
183 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2214  hypothetical protein  40.19 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  42.31 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  43.33 
 
 
174 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  43.33 
 
 
174 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  38.14 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  43.86 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  44.35 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  34 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  42.86 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  38.74 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  40.78 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  39.83 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  34.19 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  41.12 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  33.65 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  34.96 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  40.38 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  36.56 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0483  hypothetical protein  28.97 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.344031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1752  hypothetical protein  48.65 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32818  predicted protein  35.85 
 
 
220 aa  63.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2150  hypothetical protein  38.1 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  28.21 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1979  hypothetical protein  27.1 
 
 
224 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3265  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.460792  decreased coverage  0.00938661 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 
245 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03090  expressed protein  33.03 
 
 
226 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379491  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  30.97 
 
 
252 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>