14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0190 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1264  RNA polymerase dimerisation  61.7 
 
 		 96 aa  120  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.818462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1412  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  60.64 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0692  RNA polymerase dimerisation  60.64 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202688  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  65.96 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  41.86 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  34.78 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  31.65 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  28.41 
 
 		 92 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  26.67 
 
 		 95 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  28.24 
 
 		 94 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  31.52 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  31.25 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  30.38 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>