19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0560 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  946    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  31.05 
 
 
589 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  28.99 
 
 
591 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  30.33 
 
 
755 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  29.84 
 
 
502 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  26.45 
 
 
271 aa  87.4  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  29.96 
 
 
282 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  26.87 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  27.03 
 
 
347 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  27.86 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  20.86 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  24.35 
 
 
309 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  26.77 
 
 
310 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  25.09 
 
 
309 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  25.83 
 
 
309 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  27.16 
 
 
268 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  22.83 
 
 
307 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  26.91 
 
 
313 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  24.37 
 
 
252 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>