45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03554 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03554  putative methyltransferase SAM dependent  100 
 
 
222 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3929  putative methyltransferase  52.36 
 
 
225 aa  247  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1006  hypothetical protein  44.49 
 
 
251 aa  207  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0575  putative methyltransferase  44.13 
 
 
220 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.675433  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0699  putative methyltransferase  40.65 
 
 
223 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.25876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2933  putative methyltransferase  43.46 
 
 
264 aa  167  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2495  putative methyltransferase  39.72 
 
 
236 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1999  putative methyltransferase  39.46 
 
 
225 aa  148  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2334  putative methyltransferase  36.92 
 
 
260 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2885  putative methyltransferase  33.48 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00121582  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40360  predicted protein  34.36 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1997  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.87 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  hitchhiker  0.00554858 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1109  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.02 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5871  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.77 
 
 
288 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0707  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.09 
 
 
274 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5326  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.73 
 
 
234 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1731  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.3 
 
 
273 aa  48.1  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0313572  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3879  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.25 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.9609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0195  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1569  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.82 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0334963  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3278  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.41 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.44 
 
 
259 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  32.93 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3624  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.2 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1443  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.76 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3593  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.32 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.913718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2026  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.97 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1021  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  29.06 
 
 
243 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13718  normal  0.410513 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2013  hypothetical protein  20.97 
 
 
273 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2778  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.2 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0134218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.37 
 
 
447 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3592  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  24.29 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010395  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1403  putative methyltransferase  23.39 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.454064  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3362  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  23.33 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3205  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.84 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0972746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  44.44 
 
 
429 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0960  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  25.47 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.141483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1026  hypothetical protein  24.12 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.07 
 
 
254 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4494  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  30.3 
 
 
245 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  42.5 
 
 
441 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  42.5 
 
 
441 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  28.4 
 
 
426 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2748  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  22.49 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>