More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01255 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1534  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.69 
 
 		 508 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.976623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2341  6-phosphogluconate dehydrogenase  64.21 
 
 		 510 aa  713    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1902  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.1 
 
 		 508 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1723  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.29 
 
 		 508 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2561  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.67 
 
 		 513 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2824  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.1 
 
 		 508 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3220  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.14 
 
 		 517 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0151158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2969  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.1 
 
 		 508 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.727266  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2842  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.9 
 
 		 508 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01255  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 517 aa  1081    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.602496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1935  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.77 
 
 		 521 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1461  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.31 
 
 		 517 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1609  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.9 
 
 		 508 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1684  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.7 
 
 		 508 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2724  6-phosphogluconate dehydrogenase  61.3 
 
 		 509 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2794  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.89 
 
 		 511 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000310387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1677  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.9 
 
 		 508 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1365  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.6 
 
 		 511 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3505  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  57.14 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.79 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.88 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.68 
 
 		 523 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2937  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  50.9 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  49.19 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47.89 
 
 		 490 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  48.88 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.08 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.68 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  47.21 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.95 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  47.39 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.65 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.3 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.3 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.3 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.3 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.3 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.75 
 
 		 477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.3 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.42 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.64 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.26 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.42 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69500  6-phosphogluconate dehydrogenase  47.62 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239936  normal  0.16474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.76 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  46.17 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.84 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.47 
 
 		 485 aa  445  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.17 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.45 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.32 
 
 		 484 aa  442  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.17 
 
 		 468 aa  442  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.29 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.53 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.77 
 
 		 468 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.36 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.51 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.23 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.36 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.36 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.36 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.97 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.36 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.23 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.16 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.03 
 
 		 468 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  44.74 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.36 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.16 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.16 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03954  hypothetical protein similar to 6-phosphogluconate dehydrogenase (Eurofung)  47.29 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0543109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.82 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.82 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.82 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.71 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.82 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.23 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.76 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.64 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.94 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2810  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.76 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2765  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.76 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1244  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.66 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.95 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.22 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.03 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0111  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.05 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0101  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.05 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  45.23 
 
 		 482 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1948  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.26 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.05 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.03 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.75 
 
 		 470 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.75 
 
 		 470 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>