66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5899 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5899  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  377  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0991  hypothetical protein  69.59 
 
 
195 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351934  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  46.88 
 
 
189 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  44.15 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  49.71 
 
 
189 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 
257 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  23.53 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  28.67 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  29.76 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  41.03 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  27.98 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4506  protein of unknown function DUF820  31.39 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  27.92 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  30.86 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  35.37 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  32.18 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.78 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.76 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  29.67 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  28.75 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  37.04 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.29 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  33.75 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4303  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  32.76 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  31.14 
 
 
201 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2946  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
188 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  23.3 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3150  protein of unknown function DUF820  27.21 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000141566  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4400  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  24.85 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  28.76 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  24.29 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 
195 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  23.32 
 
 
192 aa  45.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  22.62 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  29.33 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  37.18 
 
 
223 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  29.88 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4452  protein of unknown function DUF820  26.72 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  0.551953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  25.9 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4389  protein of unknown function DUF820  26.72 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  38.16 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  24.1 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  29.11 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0921  hypothetical protein  28.68 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  27.33 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  27.85 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  40.38 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0761  hypothetical protein  27.66 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.591699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  34.01 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  48.78 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  27.86 
 
 
187 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  25.29 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0998  hypothetical protein  28.68 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  23.49 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5076  protein of unknown function DUF820  39.13 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>