36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5607 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
70 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4689  4-oxalocrotonate tautomerase  85.71 
 
 
70 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.091228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1419  4-oxalocrotonate tautomerase  62.86 
 
 
74 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3262  4-oxalocrotonate tautomerase  58.82 
 
 
72 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4901  4-oxalocrotonate tautomerase  58.82 
 
 
72 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3427  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4438  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4257  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  60 
 
 
72 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2693  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.46733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  45.9 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3312  4-oxalocrotonate tautomerase  41.54 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4696  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194693  hitchhiker  0.00079321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1993  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.62 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  48.28 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  49.12 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.86 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.61 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  34.33 
 
 
66 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.51 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  33.8 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>