24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2730 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
145 aa  278  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  69.4 
 
 
134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.86 
 
 
135 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  37.59 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  36.57 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  37.84 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  35.07 
 
 
152 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  35.16 
 
 
134 aa  84  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  32.84 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  37.17 
 
 
360 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  34.59 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  35.07 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  35.96 
 
 
355 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  35.61 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  32.84 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  34.85 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  38.66 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  30.83 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  31.93 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  32.2 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  33.9 
 
 
355 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  24.22 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>