85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2336 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2336  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 		 321 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126537  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0274  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  83.02 
 
 		 321 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1991  putative ferredoxin-NAD reductase component  50.16 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2030  putative ferredoxin-NAD reductase component  48.24 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2305  putative ferredoxin-NAD reductase component  48.56 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0479254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2675  ferredoxin  45.83 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.237463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0136  ferredoxin  44.17 
 
 		 347 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0780915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0219  ferredoxin  43.35 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1592  putative ferredoxin-NAD reductase component  48.23 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4333  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  31.44 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2827  putative ferredoxin--NAD(+) reductase  33.54 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0164  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.07 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000937839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2668  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.61 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.89 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  28.09 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.29 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.2 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.19 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  26.32 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.52 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.82 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.7 
 
 		 752 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.08 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  23.97 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.17 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0951  propane monoxygenase reductase  26.97 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.25 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0711  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.44 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.41 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.29 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0575  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  21.16 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.07 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.41 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.54 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  25.62 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.98 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.54 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.48 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.36 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.32 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.55 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.19 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.76 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.82 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.39 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.39 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  28.39 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.54 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.86 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  25.14 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.72 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.97 
 
 		 245 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.75 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5674  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.96 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.06 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.11 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  27.74 
 
 		 599 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  30.61 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.16 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  28.99 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2756  ferredoxin  30.77 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.624393  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  36.15 
 
 		 514 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.48 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  36.15 
 
 		 508 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  22.15 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0217103 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  36.15 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2749  putative flavodoxin oxidoreductase  26.71 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  37.69 
 
 		 506 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  28.21 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.27 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  37.69 
 
 		 506 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34 
 
 		 371 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.64 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.27 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2602  hypothetical protein  24.84 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.25 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  22.15 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  37.69 
 
 		 520 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.1 
 
 		 562 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>