34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1904 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  82.74 
 
 
1281 bp  761    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  81.95 
 
 
1308 bp  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  87.83 
 
 
1281 bp  1277    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1904    100 
 
 
1357 bp  2690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5532  hypothetical protein  91.98 
 
 
582 bp  595  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  88.93 
 
 
579 bp  591  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4175    86.83 
 
 
615 bp  567  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5574    87.13 
 
 
464 bp  450  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0991    89.37 
 
 
523 bp  408  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1920    85.19 
 
 
385 bp  303  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1319    85.76 
 
 
386 bp  268  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0972331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5024    88.37 
 
 
376 bp  258  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2555    84.32 
 
 
434 bp  228  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5575    84.15 
 
 
242 bp  206  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6312    81.44 
 
 
1371 bp  206  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  91.08 
 
 
435 bp  200  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2396    84.84 
 
 
345 bp  190  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  89.61 
 
 
555 bp  178  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4333  transposase  89.44 
 
 
321 bp  163  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4176    92.59 
 
 
132 bp  151  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3379    85.41 
 
 
193 bp  137  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3451  hypothetical protein  89.17 
 
 
225 bp  135  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3168    83.09 
 
 
266 bp  87.7  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  85.26 
 
 
732 bp  77.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8298    86.05 
 
 
180 bp  75.8  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.013738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1209    85.94 
 
 
426 bp  56  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  93.75 
 
 
1368 bp  48.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>