21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2555 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2555    100 
 
 
434 bp  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1904    84.32 
 
 
1357 bp  228  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  83.54 
 
 
1281 bp  206  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  83.12 
 
 
1281 bp  194  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  80.46 
 
 
1308 bp  159  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5532  hypothetical protein  81.82 
 
 
582 bp  157  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5574    81.36 
 
 
464 bp  145  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0991    80.34 
 
 
523 bp  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4175    81.85 
 
 
615 bp  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6312    81.35 
 
 
1371 bp  89.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1920    84.17 
 
 
385 bp  79.8  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2396    86.3 
 
 
345 bp  65.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  96.88 
 
 
732 bp  56  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3168    84.62 
 
 
266 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>