23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1883 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  338  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  57.42 
 
 
185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  51.25 
 
 
170 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  49.36 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  48.75 
 
 
177 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  51.32 
 
 
163 aa  170  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  46.79 
 
 
181 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  45.06 
 
 
164 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  39.49 
 
 
188 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  39.74 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  40.26 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  39.74 
 
 
170 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  38.16 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  42.31 
 
 
184 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  58.43 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  34.39 
 
 
165 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  32.28 
 
 
164 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5693  hypothetical protein  58.93 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.494471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  29.7 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  27.03 
 
 
159 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  27.56 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  27.82 
 
 
532 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.08 
 
 
368 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>