19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1804 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.97 
 
 		 152 aa  255  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  77.86 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.7 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  70.15 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.17 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.49 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  60.8 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.72 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.8 
 
 		 139 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  39.44 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  37.84 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  43.28 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  45.45 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1593  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.147547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>