53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1660 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  81.96 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  47.98 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  39.3 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  37.79 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  37.33 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  38.5 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  41.33 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  33.94 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  32.14 
 
 		 211 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  32.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  37.37 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  30.52 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  33.64 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  30.1 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  30.88 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  33.49 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  27.27 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  26.73 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  26.73 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  27.36 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  23.81 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  32.51 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  35.25 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  30.3 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  29.84 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  27.27 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  25.36 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  29.05 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  27.36 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  22.41 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  24.85 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  27.69 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  24.66 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  19.89 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  28.31 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  24.84 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.81 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  25.93 
 
 		 206 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.78 
 
 		 187 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.81 
 
 		 169 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  25.14 
 
 		 212 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  25.14 
 
 		 222 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  25.14 
 
 		 222 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  25.14 
 
 		 222 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  23.23 
 
 		 219 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  25.14 
 
 		 209 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  22.22 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>