39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1516 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  750    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1960  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.69 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1567  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.87 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3183  perosamine synthetase-related protein  25.95 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07761  hypothetical protein  21.97 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602159 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3042  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.79 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5114  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.8 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01560  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  36.62 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0520008 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0525  aminotransferase  30 
 
 		 255 aa  49.7  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1123  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.16 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.647735  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2343  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.97 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  36.62 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2016  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  26.96 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0529059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2228  putative aminotransferase  32.2 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0505  hypothetical protein  22.22 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.620717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1840  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.06 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.254926  normal  0.555977 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5668  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.95 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.01985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2855  aminotransferase family, DegT/DnrJ/EryC1/StrS  28.95 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  hitchhiker  0.00000526937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0132  glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.84 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000423389 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1283  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000837015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0223  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.36 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.258256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.33 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  38.6 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  34.85 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.79 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  37.29 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3183  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.77 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.233473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0364  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.26 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3628  glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.41 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  23.45 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0777  hypothetical protein  29.2 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0346  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.63 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2716  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.77 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1881  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.82 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.79 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2128  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  36.07 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.315551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1834  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.89 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3954  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.05 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>