63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1600 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  359  9e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  42.94 
 
 
172 aa  147  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  40.35 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1311  acetyltransferase  34.32 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122305  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  36.08 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  34.32 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.89 
 
 
184 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  35.76 
 
 
170 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  33.14 
 
 
170 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
170 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
169 aa  99  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1488  acetyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.68875  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
174 aa  89  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1567  acetyltransferase  31.65 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  27.88 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1053  hypothetical protein  31.52 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.4766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0909  Histone acetyltransferase  29.24 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  28.66 
 
 
365 aa  62  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  26.63 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
520 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  26.62 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.650543  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  21.23 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25.62 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  21.23 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  23.97 
 
 
176 aa  52  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  23.97 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  23.97 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  21.79 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0348  GCN5-related N-acetyltransferase  22.56 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000810741  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  21.15 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  23.23 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  22.81 
 
 
173 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0152  hypothetical protein  23.85 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2666  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.37 
 
 
530 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  28.09 
 
 
289 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5784  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3112  acetyltransferase  28.32 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3115  acetyltransferase, GNAT family  28.32 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2895  acetyltransferase  28.32 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.425529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2822  acetyltransferase  27.68 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2699  GCN5-related N-acetyltransferase  24.76 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.709564  normal  0.706077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.11 
 
 
378 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  26.15 
 
 
274 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2864  acetyltransferase  27.43 
 
 
170 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  23.01 
 
 
179 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  26.95 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  26.95 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3135  acetyltransferase, GNAT family  25.15 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  22.3 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>