34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1053 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  375  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.4766 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0909  Histone acetyltransferase  51.5 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  33.15 
 
 		 175 aa  91.3  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  31.06 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  30.51 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  32.95 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  27.68 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  28.4 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  26.86 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1567  acetyltransferase  30.34 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1311  acetyltransferase  28.18 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  28.57 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  28.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.95 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  27.98 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  27.54 
 
 		 365 aa  51.2  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  29.61 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1488  acetyltransferase  25.99 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.68875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 520 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  24.2 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>