61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4438 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  352  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  55.83 
 
 
169 aa  197  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  51.22 
 
 
172 aa  191  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  37.58 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  36.97 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  37.06 
 
 
175 aa  100  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  31.74 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  31.74 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  32.47 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
176 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  31.14 
 
 
176 aa  91.3  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  33.33 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
177 aa  88.6  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1488  acetyltransferase  32.53 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.68875  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1567  acetyltransferase  34.34 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  31.06 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  31.55 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  29.27 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1311  acetyltransferase  30.23 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  25.62 
 
 
365 aa  68.2  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  31.17 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0909  Histone acetyltransferase  27.33 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.71 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  28.65 
 
 
191 aa  61.6  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  28.74 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  26.02 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  24.12 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  26.02 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
530 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.49 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1053  hypothetical protein  25.73 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.4766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0706  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
109 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2699  GCN5-related N-acetyltransferase  23.85 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.709564  normal  0.706077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  26.67 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3118  acetyltransferase, GNAT family  28.12 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210215  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2426  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0353286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2474  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00850903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2050  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0132664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3571  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2225  acetyltransferase  25.71 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2337  acetyltransferase, GNAT family  25.71 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2069  acetyltransferase  25.71 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2009  acetyltransferase  25.71 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.079169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2008  acetyltransferase  25.71 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 
168 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4846  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.18 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2255  acetyltransferase  25.71 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0239695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2207  acetyltransferase, GNAT family  27.08 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.947983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>