69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1183 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  345  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  90 
 
 
170 aa  318  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
194 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15187  normal  0.614512 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000829593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.561407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4884  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0489648  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 
174 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
173 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
177 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06590  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.24 
 
 
184 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  32.16 
 
 
175 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0546  acetyltransferase  37.66 
 
 
176 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  unclonable  9.485090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1311  acetyltransferase  33.72 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122305  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  35.71 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  32.93 
 
 
365 aa  94  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1567  acetyltransferase  33.14 
 
 
182 aa  94  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  30.86 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1550  acetyltransferase  32.73 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000469847  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1488  acetyltransferase  30.95 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.68875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1497  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  30.54 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  30.43 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  30.43 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0909  Histone acetyltransferase  26.74 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  26.06 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.882533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1508  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1053  hypothetical protein  26.86 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.4766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 
520 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2822  acetyltransferase  28.92 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0994  acetyltransferase  32.65 
 
 
167 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5108  acetyltransferase, gnat family  25.97 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
229 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3115  acetyltransferase, GNAT family  30.2 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3112  acetyltransferase  30.2 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2895  acetyltransferase  30.2 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.425529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4788  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  26.62 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3135  acetyltransferase, GNAT family  29.53 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  26.62 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2864  acetyltransferase  30.2 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.39 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0348  GCN5-related N-acetyltransferase  23.12 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000810741  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.46 
 
 
530 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  21.95 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.650543  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3133  acetyltransferase  30.2 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  23.86 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3101  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2136  acetyltransferase, GNAT family  30.26 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2097  hypothetical protein  23.08 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  22.64 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12180  acetyltransferase (GNAT) family protein  19.57 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  32.5 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  25 
 
 
364 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
364 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  21.77 
 
 
369 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  24.44 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0152  hypothetical protein  20.74 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2253  acetyltransferase, GNAT family  26.49 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.12463e-27 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22510  predicted acyltransferase  21.49 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>