34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1261 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  100 
 
 		 400 aa  802    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  27.79 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  29.8 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  29.26 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  28.98 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  28.98 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  28.98 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  27.27 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  28.69 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  29.04 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  29.71 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  27.41 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  27.39 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  25.9 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  29.33 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 344 aa  120  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  27.95 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1463  ABC transporter EcsB  26.52 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  25.89 
 
 		 399 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  25.89 
 
 		 399 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  25.63 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  25.63 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  30.46 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  24.56 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  24.03 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  23.77 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  23.47 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  23.47 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  23.24 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1923  ABC transporter EcsB  21.96 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0127322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1889  ABC transporter EcsB  21.96 
 
 		 407 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  23.29 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1273  ABC transporter permease  27.78 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.957115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>