16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2452 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  40.81 
 
 		 211 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  35.91 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  36.74 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  40.83 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  49.17 
 
 		 138 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  42.5 
 
 		 140 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3028  hypothetical protein  43.7 
 
 		 146 aa  95.1  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  27.73 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  26.01 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  26.25 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2597  hypothetical protein  33.72 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  25.65 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>