19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2005 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  100 
 
 		 392 aa  817    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  100 
 
 		 392 aa  817    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  67.81 
 
 		 366 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  59.9 
 
 		 378 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  57.99 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  55.79 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  50.27 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  54.26 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3716  anticodon nuclease  51.5 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  32.31 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  33.06 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  30.71 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0776  anticodon nuclease  35.34 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0815  anticodon nuclease  45.45 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  31.31 
 
 		 810 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  29.52 
 
 		 643 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  23.74 
 
 		 757 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  32.97 
 
 		 881 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  29.52 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>