21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0219 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0219  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1333  hypothetical protein  89.68 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.280525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  34.68 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  48.39 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  48.39 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0168  hypothetical protein  49.46 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  34.11 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  35.83 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  29.17 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  41.18 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  36.73 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0648  hypothetical protein  34.83 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1115  hypothetical protein  35.82 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  37.04 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  29.27 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  36.62 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  32.71 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0906  hypothetical protein  37.68 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000104891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0764  hypothetical protein  35.71 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  35.44 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>