12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4313 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4313  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 340 aa  704    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2978  peptidase domain protein  65.28 
 
 		 344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0821  peptidase, metallopeptidase  35.8 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.569838  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  38.5 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0499  peptidase M12A, astacin  29.84 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  51.92 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1096  hypothetical protein  32.58 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1097  hypothetical protein  33.81 
 
 		 244 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1339  hypothetical protein  32.8 
 
 		 277 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4249  peptidase M12A, astacin  28.51 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1530  hypothetical protein  31.71 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0114  hypothetical protein  27.05 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>