More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1598 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  97.26 
 
 		 74 bp  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  96.88 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  96.83 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>