19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4102 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4102  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  311  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  53.96 
 
 
166 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  37.7 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  36.89 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  32.59 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  32.06 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  35.65 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  40.17 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  35.9 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  35.9 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  37.86 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  35.9 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  32.46 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  31.65 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  32.48 
 
 
323 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  33.91 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  30.4 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>