20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2147 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  55.02 
 
 		 675 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  100 
 
 		 682 aa  1370    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  47.25 
 
 		 685 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5721  protein of unknown function DUF187  26.84 
 
 		 557 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.82272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  29.55 
 
 		 690 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3131  hypothetical protein  26.73 
 
 		 754 aa  138  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618115  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2232  hypothetical protein  26.83 
 
 		 770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1998  hypothetical protein  26.02 
 
 		 773 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0589983  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  22.59 
 
 		 721 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  22.2 
 
 		 704 aa  87  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  24.8 
 
 		 744 aa  87  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0556  protein of unknown function DUF187  24.4 
 
 		 705 aa  84  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3374  protein of unknown function DUF187  22.52 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000681904  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  27.22 
 
 		 395 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  25.38 
 
 		 718 aa  53.9  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  30.58 
 
 		 663 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  19.63 
 
 		 430 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  20.54 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  21.34 
 
 		 535 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  21.34 
 
 		 535 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>