More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0931 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0931  putative nitrilotriacetate monoxygenase, component A  100 
 
 
442 aa  884    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.027595  normal  0.0155722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0294  putative monooxygenase  59.78 
 
 
475 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3904  putative oxygenase  56.25 
 
 
460 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3704  putative monooxygenase  55.66 
 
 
457 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02230  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.92 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1592  monooxygenase  53.62 
 
 
521 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.147927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3486  putative oxygenase  51.49 
 
 
451 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2017  putative FMNH2-utilizing oxygenase  50.68 
 
 
455 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0632006  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1983  fmnh2-utilizing oxygenase  52.57 
 
 
448 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3877  monooxygenase  50.8 
 
 
441 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  49.66 
 
 
469 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339029  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4352  monooxygenase  48.47 
 
 
471 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3795  FMNH2-utilizing oxygenase  49.77 
 
 
458 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6191  monooxygenase  49.3 
 
 
428 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0618693  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7210  monooxygenase  44.8 
 
 
444 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  38.32 
 
 
441 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.68 
 
 
450 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.2 
 
 
440 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  37.5 
 
 
447 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.92 
 
 
445 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  37.06 
 
 
451 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  38.44 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.04 
 
 
457 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  36.77 
 
 
445 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.75 
 
 
452 aa  253  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  36.85 
 
 
429 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.4 
 
 
456 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  40.24 
 
 
450 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  37.32 
 
 
453 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  39.42 
 
 
450 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.5 
 
 
460 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  35.54 
 
 
454 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  38.5 
 
 
449 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  38.41 
 
 
455 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  38.27 
 
 
449 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  37.97 
 
 
452 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  36.95 
 
 
448 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.7 
 
 
441 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  39.37 
 
 
454 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.05 
 
 
448 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  36.76 
 
 
448 aa  245  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.44 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.73 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  38.18 
 
 
450 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  38 
 
 
449 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  33.84 
 
 
440 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.6 
 
 
439 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.25 
 
 
457 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.04 
 
 
441 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.45 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  36.28 
 
 
441 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  38.62 
 
 
461 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.7 
 
 
457 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  38.73 
 
 
434 aa  240  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  35.57 
 
 
457 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  38.08 
 
 
454 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  37.09 
 
 
444 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.1 
 
 
447 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  36.4 
 
 
458 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  36.98 
 
 
448 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  36.87 
 
 
444 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.06 
 
 
439 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  37.33 
 
 
442 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  36.64 
 
 
457 aa  236  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  36.88 
 
 
447 aa  235  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.03 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  34.88 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.82 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  34.9 
 
 
1121 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.02 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  34.35 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  36.69 
 
 
448 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  35.79 
 
 
442 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  35.62 
 
 
458 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  36.16 
 
 
445 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  35.1 
 
 
492 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  35.29 
 
 
474 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.17 
 
 
449 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.53 
 
 
445 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.26 
 
 
495 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.26 
 
 
468 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  34.27 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  35.53 
 
 
444 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.86 
 
 
441 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.35 
 
 
448 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  36.61 
 
 
443 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.33 
 
 
440 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  35.16 
 
 
443 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  35.41 
 
 
441 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
440 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
440 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.79 
 
 
468 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.33 
 
 
440 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.74 
 
 
444 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.33 
 
 
440 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.33 
 
 
440 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.33 
 
 
440 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  36.21 
 
 
445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  36.07 
 
 
472 aa  223  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>